Kerjasama yang telah terjalin antara Program Studi S2 Teknologi Hasil Pertanian dan Instansi Pemerintah maupun industri, antara lain :

1. Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (BPPT)

2. University of Kentucky, USA

3. University of Queensland, Australia

4. Yamaguchi University, JepangĀ 

5. Universiti Putra Malaysia

6. National Pingtung University of Science and Technology, Taiwan

7. Prince of Songkla University, Thailand

8. Chiang Mai University, Thailand

9. King Mongkut University, Thailand

10. Catholic University of Daegu, Korea Selatan

11. PT. Indolakto

12. PT. Ajinomoto

13. PT. Cheil Jedang

14. PT. Molindo Raya